Морские гимназические классы созданы в сентябре 1992 года в параллели 7-11 классов согласно Постановлению Главы Администрации г. Полярного Любимникова П.С. (№240 от 21 сентября 1992 года и на основании Договора между Государственной Морской Академией имени адмирала С.О. Макарова (г. С.-Петербург), командованием Кольской флотилии и СШ №3).

В морских классах углублённо изучаются предметы физико-матматического цикла. Ученики этих классов занимают призовые места на городских и областных олимпиадах, являются победителями научно-практических конференций.

До 2003 года в ряды гардемаринов вступали только мальчики. Но 2003 год стал ообенным - в ряды морской гвардии впервые приняли и девочек.